MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W plasmid pLC2W

Total Repeats: 546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017475	TCG	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821657
2	NC_017475	TGGT	2	8	293	300	0 %	50 %	50 %	0 %	385821657
3	NC_017475	ATT	2	6	301	306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821657
4	NC_017475	ACT	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821657
5	NC_017475	CTG	2	6	457	462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821658
6	NC_017475	GAG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821658
7	NC_017475	TTG	2	6	824	829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821659
8	NC_017475	GGC	2	6	880	885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821659
9	NC_017475	TGG	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821659
10	NC_017475	GAC	2	6	1104	1109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821659
11	NC_017475	CAG	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821659
12	NC_017475	CTT	2	6	1260	1265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821659
13	NC_017475	CAA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821660
14	NC_017475	GCA	2	6	1350	1355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821660
15	NC_017475	TCG	2	6	1452	1457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821660
16	NC_017475	TTGT	2	8	1480	1487	0 %	75 %	25 %	0 %	385821660
17	NC_017475	CCT	2	6	1576	1581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385821660
18	NC_017475	AAC	3	9	1980	1988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821661
19	NC_017475	AGA	2	6	2053	2058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821661
20	NC_017475	GAG	2	6	2062	2067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821661
21	NC_017475	AGA	2	6	2092	2097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821661
22	NC_017475	A	6	6	2147	2152	100 %	0 %	0 %	0 %	385821661
23	NC_017475	GTG	2	6	2166	2171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821661
24	NC_017475	ATT	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821661
25	NC_017475	CAGG	2	8	2283	2290	25 %	0 %	50 %	25 %	385821661
26	NC_017475	A	6	6	2414	2419	100 %	0 %	0 %	0 %	385821661
27	NC_017475	AAG	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821661
28	NC_017475	TCA	2	6	2528	2533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821661
29	NC_017475	ACT	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821661
30	NC_017475	CGAC	2	8	2600	2607	25 %	0 %	25 %	50 %	385821661
31	NC_017475	TGAG	2	8	2740	2747	25 %	25 %	50 %	0 %	385821661
32	NC_017475	ACGA	2	8	2749	2756	50 %	0 %	25 %	25 %	385821661
33	NC_017475	TCA	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821661
34	NC_017475	GCT	2	6	3000	3005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821662
35	NC_017475	AT	3	6	3011	3016	50 %	50 %	0 %	0 %	385821662
36	NC_017475	ATC	3	9	3054	3062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821662
37	NC_017475	ATG	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821662
38	NC_017475	TGAC	2	8	3211	3218	25 %	25 %	25 %	25 %	385821662
39	NC_017475	CAAAT	2	10	3244	3253	60 %	20 %	0 %	20 %	385821662
40	NC_017475	TAC	2	6	3399	3404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821662
41	NC_017475	CGC	2	6	3583	3588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821662
42	NC_017475	TCT	2	6	3646	3651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821662
43	NC_017475	TGT	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821662
44	NC_017475	CAG	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821662
45	NC_017475	GCA	2	6	3731	3736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821662
46	NC_017475	CAGG	2	8	3741	3748	25 %	0 %	50 %	25 %	385821662
47	NC_017475	TGG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821662
48	NC_017475	TCA	2	6	3835	3840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821662
49	NC_017475	TTC	2	6	3960	3965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821662
50	NC_017475	ATG	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821662
51	NC_017475	CCATG	2	10	4051	4060	20 %	20 %	20 %	40 %	385821662
52	NC_017475	CATT	2	8	4165	4172	25 %	50 %	0 %	25 %	385821662
53	NC_017475	GAA	2	6	4200	4205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821662
54	NC_017475	GAC	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821662
55	NC_017475	GAC	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821662
56	NC_017475	CAAA	2	8	4370	4377	75 %	0 %	0 %	25 %	385821662
57	NC_017475	TG	3	6	4399	4404	0 %	50 %	50 %	0 %	385821662
58	NC_017475	TGG	3	9	4406	4414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821662
59	NC_017475	AAAC	2	8	4442	4449	75 %	0 %	0 %	25 %	385821662
60	NC_017475	GCC	3	9	4479	4487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821662
61	NC_017475	A	6	6	4574	4579	100 %	0 %	0 %	0 %	385821662
62	NC_017475	CAA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821662
63	NC_017475	CAA	2	6	4643	4648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821662
64	NC_017475	TTG	2	6	4669	4674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821662
65	NC_017475	CCG	2	6	4758	4763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821663
66	NC_017475	CCA	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821663
67	NC_017475	ATC	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821663
68	NC_017475	ATG	2	6	4881	4886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821663
69	NC_017475	GCC	2	6	5024	5029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821663
70	NC_017475	CAT	2	6	5030	5035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821663
71	NC_017475	CAT	2	6	5057	5062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821663
72	NC_017475	GAC	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821663
73	NC_017475	GAA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821663
74	NC_017475	GAAGT	2	10	5165	5174	40 %	20 %	40 %	0 %	385821663
75	NC_017475	CAA	2	6	5213	5218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821663
76	NC_017475	TGG	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821663
77	NC_017475	TA	3	6	5319	5324	50 %	50 %	0 %	0 %	385821663
78	NC_017475	GCC	2	6	5411	5416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821663
79	NC_017475	ATC	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821663
80	NC_017475	TGA	2	6	5566	5571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821663
81	NC_017475	TTG	2	6	5592	5597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821663
82	NC_017475	AAT	2	6	5603	5608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821663
83	NC_017475	CG	3	6	5689	5694	0 %	0 %	50 %	50 %	385821663
84	NC_017475	GAC	2	6	5737	5742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821663
85	NC_017475	GATTGG	2	12	5744	5755	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385821663
86	NC_017475	AAAG	2	8	5855	5862	75 %	0 %	25 %	0 %	385821663
87	NC_017475	GATT	2	8	5911	5918	25 %	50 %	25 %	0 %	385821663
88	NC_017475	ATG	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821663
89	NC_017475	TTC	2	6	6047	6052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821663
90	NC_017475	CAAA	2	8	6082	6089	75 %	0 %	0 %	25 %	385821663
91	NC_017475	TGAG	2	8	6111	6118	25 %	25 %	50 %	0 %	385821663
92	NC_017475	CAT	2	6	6124	6129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821663
93	NC_017475	CTA	2	6	6192	6197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821664
94	NC_017475	AAG	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821664
95	NC_017475	TGGT	2	8	6213	6220	0 %	50 %	50 %	0 %	385821664
96	NC_017475	GCT	2	6	6257	6262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821664
97	NC_017475	TGCA	2	8	6264	6271	25 %	25 %	25 %	25 %	385821664
98	NC_017475	CAAC	2	8	6352	6359	50 %	0 %	0 %	50 %	385821664
99	NC_017475	AAG	2	6	6378	6383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821664
100	NC_017475	TGA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821664
101	NC_017475	TGA	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821664
102	NC_017475	T	6	6	6744	6749	0 %	100 %	0 %	0 %	385821665
103	NC_017475	GTT	2	6	6750	6755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821665
104	NC_017475	TTA	2	6	6756	6761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821665
105	NC_017475	GCG	2	6	6765	6770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821665
106	NC_017475	GT	3	6	6780	6785	0 %	50 %	50 %	0 %	385821665
107	NC_017475	GGC	2	6	6980	6985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821666
108	NC_017475	CTG	2	6	7110	7115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821667
109	NC_017475	CGT	2	6	7238	7243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821667
110	NC_017475	CCA	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821667
111	NC_017475	GCC	2	6	7463	7468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821667
112	NC_017475	CAA	2	6	7519	7524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821667
113	NC_017475	CTC	2	6	7852	7857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385821668
114	NC_017475	CAG	2	6	7886	7891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821668
115	NC_017475	ATT	2	6	7909	7914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821668
116	NC_017475	TTA	2	6	8000	8005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821669
117	NC_017475	AATG	2	8	8195	8202	50 %	25 %	25 %	0 %	385821669
118	NC_017475	T	7	7	8207	8213	0 %	100 %	0 %	0 %	385821669
119	NC_017475	CCT	2	6	8243	8248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385821669
120	NC_017475	GGC	2	6	8390	8395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821669
121	NC_017475	CTC	2	6	8569	8574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385821670
122	NC_017475	TCA	2	6	8705	8710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821670
123	NC_017475	GTT	2	6	8774	8779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821670
124	NC_017475	CAA	2	6	8780	8785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821670
125	NC_017475	GTCC	2	8	8801	8808	0 %	25 %	25 %	50 %	385821670
126	NC_017475	T	6	6	8850	8855	0 %	100 %	0 %	0 %	385821670
127	NC_017475	GTT	2	6	8874	8879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821670
128	NC_017475	GTA	2	6	8892	8897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821670
129	NC_017475	GATA	2	8	8923	8930	50 %	25 %	25 %	0 %	385821670
130	NC_017475	ACC	2	6	9030	9035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821670
131	NC_017475	T	6	6	9059	9064	0 %	100 %	0 %	0 %	385821670
132	NC_017475	ATC	2	6	9075	9080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821670
133	NC_017475	GAC	2	6	9087	9092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821670
134	NC_017475	ACC	2	6	9117	9122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821670
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